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基于16S rRNA基因克隆文库技术分析广西富钟水牛瘤胃产甲烷菌组成及多样性

来源:论文学术网
时间:2024-08-18 17:39:05
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基于16S rRNA基因克隆文库技术分析广西富钟水牛瘤胃产甲烷菌组成及多样性【摘要】:本研究旨在利用16S rRNA基因克隆库技术分析广西富钟水牛瘤胃产甲烷菌组成及多样性。选取3头

【摘要】:本研究旨在利用16S rRNA基因克隆库技术分析广西富钟水牛瘤胃产甲烷菌组成及多样性。选取3头体况基本一致的健康雌性富钟水牛作为试验动物,采用机械破壁法提取瘤胃内容物总DNA,采用产甲烷菌引物Met86F/Met1340R扩增16S rRNA基因,构建16S rRNA基因克隆文库。结果表明,本试验共获得93个非嵌合体16S rRNA序列,按照97%的相似性划分为39个分类操作单元(OTU)。其中,60个序列(15个OTU)与已培养细菌16S rRNA序列相似性≥97%,占总序列的64.5%;32个序列(23个OTU)与已培养菌16S rRNA序列相似性处于90%~(97%);仅有1个序列与Methanomassiliicoccus luminyensis相似性90%。系统发育树分析表明,98.9%的序列均属于甲烷杆菌目(Methanobacteriales),部分序列与Methanobacteriales中任何已知相似序列都相隔较远,它们可能代表Methanobacteriales中新的属或种。由上述结果可见,富钟水牛瘤胃产甲烷菌以Methanobacteriales为优势菌群,其中有许多未知的产甲烷菌需进一步分离培养并对其功能进行分析。 【作者单位】: 中国农业科学院广西水牛研究所 农业部(广西)水牛遗传繁育重点实验室;
【关键词】富钟水牛 瘤胃 产甲烷菌 多样性
【基金】:广西自然基金青年基金项目(2012GXNSFBA053070) 广西水产畜牧兽医局科技计划项目(桂渔牧科1304516) 农业部948项目(2011-G26)
【分类号】:S823
【正文快照】: 广西富钟水牛是我国地方水牛的特色品种之一,2006年被列入《国家级畜禽遗传资源保护名录》[1]。富钟水牛体型较大,具有繁殖力高、成熟早、肉质好、性情温顺、耐粗饲等优良特性[2-3],适合广西壮族自治区东北丘陵地带以低洼水田及黏性土壤旱地的耕作环境条件生长。然而,据2009年

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