基于mcrA基因的厌氧颗粒污泥产甲烷菌群分析

【摘要】：基于mcrA基因对阿维菌素废水处理工业化UASB厌氧颗粒污泥中产甲烷菌群进行分析,并与基于16S rRNA基因的产甲烷菌群分析结果进行比较.结果表明,基于2种目标基因PCR产物的DGGE图谱存在差异,但根据图谱计算所得产甲烷菌群Shannon多样性指数、Margalef丰富度指数和Berger-Parker优势度指数没有差异,表明基于2种目标基因的产甲烷菌群多样性分析基本一致.基于不同目标基因的优势产甲烷菌群系统发育种属的分析结果大体相似,产甲烷杆菌目和产甲烷八叠球菌目是厌氧颗粒污泥样品中的优势产甲烷种群;同时,分析结果的差异表明2种目标基因的检测特异性不完全相同.基于2种目标基因的产甲烷菌群FISH杂交区域具有很高的一致性,但杂交区域面积有所差异.基于mcrA基因FISH检测的产甲烷菌群平均相对丰度为24.25%±6.47%,低于基于16S rRNA基因FISH检测结果(33.42%±2.34%).以上结果表明,基于mcrA基因与基于16S rRNA基因的的产甲污泥菌群分析结果具有较高的相似度,mcrA基因可以作为16S rRNA基因的替代目标基因. 【作者单位】： 河北科技大学环境科学与工程学院;科技部基础研究管理中心;
【关键词】： mcrA基因 厌氧颗粒污泥 产甲烷菌群 PCR-DGGE FISH
【基金】：国家自然科学基金项目(50878072) 河北省自然科学基金项目(E2008000694,E2009000709)
【分类号】：X703
【正文快照】： 厌氧颗粒污泥是高效厌氧反应器稳定和高效运行的关键,产甲烷菌群是厌氧颗粒污泥中的主要功能菌群,UASB颗粒污泥中的产甲烷菌数量可达109/mL[1].目前,现代分子生物学技术已经广泛应用于包括厌氧颗粒污泥在内的不同环境样品中的产甲烷菌群分析[2～13],而且多数研究都是基于16S r

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