一株Ⅱ型甲烷氧化菌中甲烷单加氧酶基因和16S rDNA的分析

【摘要】：【目的】利用分子生物学方法对一株甲烷氧化菌Methylosinus trichosporium IMV3011中的16S rDNA和溶解性甲烷单加氧酶基因序列进行分析并探索其进化分类地位。【方法】利用基因数据库已有的基因序列信息,设计PCR扩增引物和基因测序引物,对溶解性甲烷单加氧酶基因和16S rDNA进行扩增和测序,并进行溶解性甲烷单加氧酶的6个基因和氨基酸序列与同类菌株的相应序列进行联配分析。【结果】获得了全长为5319bp甲烷单加氧酶基因序列和长度为1290bp的16S rDNA序列。该菌株与Methylosinus trichosporium OB3b中相对应基因的同一性是99.0%～82.7%,MMOX氨基酸序列的同一性为99.4%～81.8%,相似性为99.8%～89.2%。基于以上分析表明MMOX组分有很高的序列保守性,特别是在活性中心区域。【结论】菌株IMV3011属于甲基弯菌属,最近似的菌株是Methylosinus trichosporium OB3b。 【作者单位】： 中国科学院兰州化学物理研究所羰基合成与选择氧化国家重点实验室;
【关键词】： 甲烷氧化菌 甲烷单加氧酶 基因测序 S rDNA 进化分析
【基金】：国家自然科学基金(20573124,20873167)~~
【分类号】：Q93
【正文快照】： 甲烷氧化细菌能够利用甲烷为唯一碳源和能源,在温和条件下实现甲烷氧化生成甲醇。甲烷氧化细菌主要分为3种类型,TypeⅠ、TypeⅡ和TypeⅩ甲烷氧化细菌。目前,已经有多个甲烷氧化细菌被研究[1-2]。在甲烷氧化细菌中主要的酶系是甲烷单加氧酶(Methane monooxygenase,MMO),在细胞

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