新一代高通量测序与稳定性同位素示踪DNA/RNA技术研究稻田红壤甲烷氧化的微生物过程
来源:论文学术网
时间:2024-08-18 16:57:13
热度:
新一代高通量测序与稳定性同位素示踪DNA/RNA技术研究稻田红壤甲烷氧化的微生物过程【摘要】:【目的】利用新一代高通量测序技术分析复杂土壤环境中整体微生物群落结构的变化规律,研究特
【摘要】:【目的】利用新一代高通量测序技术分析复杂土壤环境中整体微生物群落结构的变化规律,研究特定功能微生物生理过程的分子机制;利用稳定性同位素示踪微生物核酸DNA/RNA,研究复杂土壤中关键元素转化的微生物调控机制。【方法】针对我国第四纪红色粘土母质发育的3种稻田红壤,围绕13C-甲烷好氧氧化的微生物过程,在DNA和RNA水平高通量测序土壤微生物群落16S rRNA基因和16S rRNA,通过超高速密度梯度离心土壤微生物总核酸获得13C-标记的DNA/RNA,进一步采用克隆文库技术研究稻田红壤甲烷好氧氧化的微生物作用者。【结果】新一代高通量测序结果表明,3种稻田红壤甲烷的好氧氧化过程中,甲烷好氧氧化菌占土壤整体微生物群落的丰度显著增加,RNA水平的增幅显著高于DNA水平,能够更为灵敏地反映土壤甲烷好氧氧化的微生物过程。3种稻田红壤甲烷的好氧氧化过程中,类型Ⅰ和类型Ⅱ甲烷好氧氧化菌在湖南古市土壤中显著增加,湖南桃源土壤中类型Ⅱ甲烷好氧氧化菌增加明显,而类型I甲烷好氧氧化菌在广东雷州土壤中增幅最大。进一步利用13C-DNA和13C-RNA分别构建pmoA基因和16S rRNA克隆文库,发现类型I甲烷好氧氧化菌主导了湖南古市和广东雷州稻田红壤甲烷的好氧氧化过程,类型II甲烷好氧氧化菌主导了湖南桃源稻田红壤甲烷的好氧氧化过程。【结论】新一代高通量测序技术能够在整体微生物群落水平,清楚反映复杂土壤中特定功能微生物的生理生态过程,而RNA较DNA水平的分析更为灵敏;稳定性同位素示踪微生物核酸DNA/RNA技术能够准确地揭示复杂土壤重要过程的微生物作用者。
【作者单位】:
中国科学院南京土壤研究所 土壤与农业可持续发展国家重点实验室;中国科学院大学;
【关键词】: 新一代高通量测序 稳定性同位示踪DNA/RNA 稻田红壤 甲烷好氧氧化
【基金】:国家自然科学基金(41090281,31270147) 中国科学院应用微生物研究网络项目(KSCX2-EW-G-16)~~
【分类号】:S154.3
【正文快照】: 21世纪以来,DNA测序技术取得革命性突破,新一代高通量测序技术将成为一种常规手段研究土壤微生物多样性,类似于目前土壤氮磷钾等营养元素的化学分析,成为土壤质量评价的常规方法。同时,新一代高通量测序是耦合研究土壤微生物多样性及其生态环境功能的关键技术。据估算,每克土
【关键词】: 新一代高通量测序 稳定性同位示踪DNA/RNA 稻田红壤 甲烷好氧氧化
【基金】:国家自然科学基金(41090281,31270147) 中国科学院应用微生物研究网络项目(KSCX2-EW-G-16)~~
【分类号】:S154.3
【正文快照】: 21世纪以来,DNA测序技术取得革命性突破,新一代高通量测序技术将成为一种常规手段研究土壤微生物多样性,类似于目前土壤氮磷钾等营养元素的化学分析,成为土壤质量评价的常规方法。同时,新一代高通量测序是耦合研究土壤微生物多样性及其生态环境功能的关键技术。据估算,每克土
您可以在本站搜索以下学术论文文献来了解更多相关内容
稳定性同位素核酸探针技术DNA-SIP原理与应用 贾仲君;
3次连续重复提取DNA能较好反映土壤微生物丰度 郭赟;吴宇澄;林先贵;钟文辉;丁维新;朱建国;贾仲君;
茶园土壤细菌丰度及其影响因子研究 韩文炎;王皖蒙;郭赟;杨明臻;贾仲君;
水稻土甲烷氧化菌对镉胁迫的响应 郑勇;郑袁明;贺纪正;
水稻土中脂肪酸互营氧化的研究进展 刘鹏飞;陆雅海;
土壤预处理对不同起源氮矿化的影响 沈其荣,史瑞和
干湿交替条件下土壤氮素转化及其影响研究进展 张威;张旭东;何红波;解宏图;白震;
一种简单有效且适于土壤微生物多样性分析的DNA提取方法 张海燕;王彩虹;龚明福;张利莉;
干土效应对土壤生物组成及矿化与硝化作用的影响 林江辉,李辉信,胡锋,赵海燕
风干水稻土氮矿化过程的相对稳定性 陶勤南,吴良欢,方萍
风干土保存时间和湿土培育时间对黄淮海平原潮土酶活性的影响 赵炳梓;陈吉;张佳宝;钦绳武;
土壤样品中DNA提取方法的比较 陈敏
上一篇:化纤印花企业的清洁生产示范工程
-
异丁酸对西门塔尔牛增重、日粮养分消化和甲烷排放的影响2024-08-18
-
惰性及特种可燃气体对甲烷爆炸特性的影响实验及分析2024-08-18
-
西湖底泥中的反硝化型甲烷厌氧氧化菌的分子生物学检测2024-08-18
-
Ni/CeO_2-SiO_2催化剂的制备、表征及其甲烷部分氧化制合成气性能(英文)2024-08-18
-
黄河口潮滩湿地土壤甲烷产生潜力及其对有机物和氮输入响应的初步研究2024-08-18
-
南海东北部硫酸盐还原-甲烷厌氧氧化界面——海底强烈甲烷渗溢的记录2024-08-18
-
体外产气法研究半胱胺对水牛瘤胃发酵参数和甲烷产量的影响2024-08-18
-
滨海湿地甲烷产生途径和产甲烷菌研究进展2024-08-18
-
4种温带森林非生长季土壤二氧化碳、甲烷和氧化亚氮通量2024-08-18
-
有机成分比例对高固体浓度厌氧发酵产甲烷的影响2024-08-18
-
富有机质页岩中主要黏土矿物吸附甲烷特性2024-08-18
-
瘤胃甲烷菌及甲烷生成的调控2024-08-18
-
生物质炭提高稻田甲烷氧化活性2024-08-18
-
填埋覆土甲烷氧化微生物及甲烷氧化作用机理研究进展2024-08-18
-
森林土壤甲烷吸收的主控因子及其对增氮的响应研究进展2024-08-18