污水处理池中两株细菌的分离及性能鉴定

【摘要】： 采用稀释平板分离法,分离纯化浙江清华长三角研究院硝化池水样和广东省珠海市某一淀粉废水处理厂氧化池水样中微生物,得到两株疑似新种,分别编号为Sphingomonas sp. BH3和Shewanella sp. DF17。 Sphingomonas sp. BH3为短杆状革兰氏阴性菌,端生单鞭毛,该菌株具有氧化酶、触酶等活性,能以葡萄糖、L-阿拉伯糖、D-半乳糖、水杨苷、麦芽糖等作为唯一碳源,不能利用葡萄糖、鼠李糖、蔗糖、麦芽糖等氧化产酸,对四环素、红霉素、卡那霉素、多粘菌素B等敏感。HPLC法测定其基因组DNA的G+C含量为65.6 mol%。基于16S rDNA序列构建了包括该菌和现有鞘氨醇单胞菌属各种在内的系统发育树,序列同源性比对表明该菌与现有鞘氨醇单胞菌属各种之间的同源性在92.6%-97.3%之间,其中与Sphingomonas melonis和Sphingomonas aquatilis相似性分别达到97.33%和97.26%。 Shewanella sp. DF17为短杆状革兰氏阴性菌,端生单鞭毛,具有氧化酶、触酶等活性,不能以葡萄糖、麦芽糖、果糖等作为唯一碳源,不能利用葡萄糖、麦芽糖等氧化产酸,对四环素、红霉素、卡那霉素、多粘菌素B等敏感,HPLC法测定其基因组DNA的G+C含量为47.8 mol%；基于16S rDNA序列构建了包括该菌和现有希瓦氏属各种在内的系统发育树,序列同源性比对表明该菌与现有希瓦氏属各种之间的同源性在90.7%-94.5%之间,其中与Shewanella algae和Shewanella haliotis相似性分别达到94.5%和94.1%。 生理生化特征及系统发育学研究等表明菌株BH3和DF17可能分别为鞘氨醇单胞菌属和希瓦氏属的新成员。其16S rDNA序列GeneBank登录号分别为FJ834325和FJ887892。两个菌株还有待多相分类学的进一步鉴定。 【关键词】：鞘氨醇单胞菌属 希瓦氏菌属 生理生化特征 16S rDNA 系统发育学分析
【学位授予单位】：西南交通大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2009
【分类号】：X172
【目录】：

• 摘要6-7
• Abstract7-11
• 第1章 绪论11-31
• 1.1 细菌分类学及多相分类学方法11-20
• 1.1.1 细菌分类学研究发展概况11-13
• 1.1.2 原核生物关于"种"的定义13-14
• 1.1.3 系统发育学14-17
• 1.1.4 多相分类学方法17-20
• 1.1.5 细菌分类学研究的发展趋势20
• 1.2 鞘氨醇单胞菌属研究进展20-26
• 1.2.1 生理生化特性21
• 1.2.2 生态分布及特征21-23
• 1.2.3 应用前景23-26
• 1.3 希瓦氏菌属研究进展26-29
• 1.3.1 生理生化特性26
• 1.3.2 生态分布及特征26-27
• 1.3.3 应用前景27-29
• 1.4 研究目的和意义29-31
• 第2章 材料与方法31-45
• 2.1 样品来源31
• 2.2 主要实验仪器与设备31
• 2.3 主要实验试剂31-32
• 2.4 富集、分离、鉴定用培养基32-33
• 2.5 参比菌株33
• 2.6 菌株的分离及保藏33-34
• 2.7 菌株表型特征34-39
• 2.7.1 形态学特征34-35
• 2.7.2 限制因子实验35
• 2.7.3 生理生化特征35-39
• 2.8 基因型特征39-44
• 2.8.1 细菌16SrDNA基因序列分析39-42
• 2.8.2 基因组DNA中(G+C)mol%含量的测定42-44
• 2.9 系统发育学分析44-45
• 第3章 结果与讨论45-64
• 3.1 菌株的分离及保藏45
• 3.2 菌株BH3和DF17的表型特征45-60
• 3.2.1 菌株形态观察45-46
• 3.2.2 限制因子实验46-49
• 3.2.3 生理生化特征49-60
• 3.3 菌株BH3和DF17的基因型特征及系统发育学分析60-64
• 3.3.1 16SrDNA基因序列相似性比较及系统发育学分析60-62
• 3.3.2 基因组DNA中(G+C)mol%含量的测定62-64
• 结论64-66
• 致谢66-67
• 参考文献67-75
• 附录175-77
• 附录277-80
• 攻读硕士学位期间发表的论文80-81

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