仔猪结肠中产甲烷菌群多样性及其与环境因子的相关性

【摘要】：【目的】为评价仔猪结肠中产甲烷菌群多样性及其与环境因子(日粮类型、断奶应激及日龄)的相关性。【方法】分别采集了7、14、21、24和35日龄仔猪结肠内容物,进行基因组总DNA的提取,运用变性梯度凝胶电泳(Denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术分析各结肠样总DNA的产甲烷菌的PCR产物,同时研究了与甲烷生成相关的结肠内挥发性脂肪酸(Volatile fatty acid,VFA)的变化情况。【结果】结果表明,仔猪结肠内容物中乙酸、丙酸和总挥发性脂肪酸(Total volatile fatty acid,TVFA)浓度随日龄增加而显著升高(P0.05),但丁酸浓度未有显著性变化(P0.05);基于Dice模式的UPGMA聚类分析的DGGE指纹图谱结果显示,7-24日龄结肠样的产甲烷菌群落结构相似性较高,聚集到一个分支上;而35日龄的结肠样聚集到另一分支上;冗余分析(Redundancy analysis,RDA)结果表明,日龄和日粮类型与产甲烷菌群落结构的关联度较高;序列分析表明,仔猪结肠食糜中甲烷菌群主要以甲烷短杆菌为主,同时存在另一类未知甲烷菌。【结论】本研究表明,甲烷短杆菌是仔猪结肠中的优势产甲烷菌,日龄和日粮类型与仔猪结肠中产甲烷菌群落结构的相关性最强。 【作者单位】： 南京农业大学动物科技学院;
【关键词】： 仔猪 结肠 产甲烷菌 变性梯度凝胶电泳 冗余分析
【基金】：国家自然科学基金(30810103909) 农业部公益项目(200903003)~~
【分类号】：S828;Q93
【正文快照】： 近年来,随着世界气候的持续变暖,极端天气的不断增多,人们对温室气体的生成及其调控愈加关注。长期以来,人们一直认为瘤胃产甲烷是动物养殖业中温室气体的主要来源,而一直忽视了单胃动物后肠甲烷生成,实际上,在我国,猪的养殖数量巨大,而猪每天甲烷产量在1.5 L左右[1]。因此,

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